四月二十二日，清军到达达禄。布尔尼早已设伏兵于山谷，列阵以待，并派三千人径直来战。鄂扎命图海、吴丹率轻骑迎战，令洪世禄率左翼搜山。当土默特兵行过山涧时，忽然有伏兵冲，阵。图海等分兵奋击，大败之。布尔尼又以四百骑继，图海率兵力战，阵前号令曰：“之前此所掠夺的财都是士庶家里的，不足以被称为宝。如今察哈尔承元朝之后，数百年的基业，珠宝货宝夺的无法计算，你们如果能获取它们，可以保证终富贵啊。”

正当清廷全力准备平叛时，蒙古的察哈尔王布尔尼乘机兴兵作，军情急。康熙帝因京师禁旅皆南征，守备空虚；又急派大臣去平叛，十分担忧，就向孝庄太皇太后问询。孝庄说：“图海才略众，可以胜任这个位置。”康熙帝遂命图海为副将军，随抚远大将军多罗信郡王鄂扎率军征讨。此时，京师已无兵力可用，图海便奏请选八旗家中的健勇者，得数万人，当天便集于德胜门外。次日黎明，图海整装至教场，检阅完毕，立即发，一路急行军，不许夜宿，所过宣府等地州县村堡，任听众家抢掠，使其获金帛无数，不数日便到达察哈尔境内。

康熙十二年（1673年）三月，平南王尚可喜以年老疏请归辽东。七月，平西王吴三桂亦上书请求撤藩，实则窥探朝廷意旨。诸臣廷议时，除莫洛、米思翰、明珠等少数人主张撤藩外，多以撤藩必为虞，反对之，图海亦持反对意见。康熙帝认为，当时三藩俱握兵权，恐日久滋蔓，驯至不测，拒绝了图海等人的意见，下令撤藩。15这次在撤不撤藩的问题上，图海站在了大多数人一边，属于比较保守求稳的一派。当年十二月，吴三桂发动叛。

而死。三天后农民军另一据黄草坪亦被攻下，郝摇旗等被俘牺牲。只有李来亨独据茅麓山凭险抵抗，清军虽有二十万众却接近不得。最后由于图海等实行长期围困，绝其粮和声援，农民军境愈加险恶。至康熙三年（1664）终于力不能支，李来亨下令烧毁山寨，阖门**而死。十月，图海与穆里玛等下令将俘获的六千余名农民军尽数屠杀，然后携带被俘的三千余人及八千余名降兵班师。

康熙六年（1667年），图海晋升为弘文院大学士，加世职为一等轻车都尉。九月，充任纂修《世祖章皇帝实录》总裁官。

康熙十三年（1674年）三月，耿忠叛应之。从此，战事开始，康熙帝倾全国兵力投了平叛战争。为了筹集军饷，康熙帝命图海理事务，负责督运军饷。图海本来已因病奏请解除阁务，但现在平叛需要他，他也就毫不犹豫地应允了。为了防止地方在征集军饷时增加百姓负担，他特意疏请饬令“一应军需不得私派，夫役不得先期拘禁，征收钱粮正项外不得丝毫科敛”，得到康熙帝准允，在一定程度上避免了横征暴敛的发生。

康熙九年（1670年）改为中和殿大学士兼礼尚书。此时他在大学士中又位列第三。康熙十年（1671年）晋居第二。康熙十一年（1672年）七月，加太太傅。声名复振，权势显赫。图海以文武之才，练任职，卓有成效，而得到青年天康熙帝的信任。

康熙七年（1668年）十二月，比利时人南怀仁劾钦天监监副吴明烜推算历法差错，图海奉命同诸大臣同往测验。后来，在康熙八年（1669年）七月、康熙九年（1670年）六月、康熙十一年（1672年）六月，他几次受命同刑审理重犯，皆称旨，不但当时就受到康熙帝的称赞，而且在几十年以后，康熙帝还以图海为例，让刑的官员向他学习。

众家听后，踊跃向前，战斗中无不以一当百，奋力杀敌，很快就将敌军打败。布尔尼又悉兵而，列火相拒，图海也严阵以待，接连重击叛军，大败之，其下都统晋津率其族阵前投降，布尔尼兄弟仅以三十骑仓皇逃遁，至扎鲁特境内贵苏特时，被前来会剿